Selaras dengan visi Ditjen P2P, Balai Kekarantinaan Kesehatan Kelas I Mataram menjabarkan visi yakni Mewujudkan Pintu Masuk Negara dan Wilayah yang bebas penyakit dan faktor risiko. Dan untuk mewujudkan visi tersebut maka Balai Kekarantinaan Kesehatan Kelas I Mataram telah menetapkan misi untuk mewujudkan yakni:
-
- Meningkatkan deteksi dini dan respon penyakit dan faktor risiko;
- Meningkatkan kualitas kesehatan lingkungan dan alat angkut di pintu masuk negara;
- Meningkatkan tata kelola kegiatan yang bersih dan akuntabel;Meningkatkan Sumber Daya Manusia.